Jednostką mobilizującą była Komenda Portu Wojennego Gdynia.
W kampanii wrześniowej dywizjon walczył w obronie Wybrzeża.
Decyzją Ministra Obrony Narodowej Antoniego Macierewicza z 13 czerwca 2017 roku 13 Dywizjon Trałowców im. admirała floty Andrzeja Karwety przejął dziedzictwo tradycji Dywizjonu Ćwiczebnego i Dywizjonu Minowców.
Organizacja i obsada personalna dyonu 31 sierpnia 1939 roku Poniżej przedstawiono organizację i obsadę personalną dyonu w dniu 31 sierpnia 1939 roku. Obok nazwy okrętu, w nawiasach, podano znak taktyczny i datę wcielenia do MW.
Dowództwo Dywizjonu Minowców dowódca dywizjonu – kmdr ppor. Zdzisław Boczkowski oficer flagowy – por. mar. Roman Potocki oficer mechanik – por. mar. Kazimierz Rekner
ORP „Jaskółka” („J”, 27 VIII 1935) dowódca okrętu – kpt. mar. Tadeusz Borysiewicz zastępca dowódcy okrętu – ppor. mar. Wacław Bielina-Bielinowicz oficer wachtowy – bosm. pchor. Piotr Cegielski
ORP „Mewa” („M”, 25 X 1935) dowódca okrętu – kpt. mar. Wacław Lipkowski zastępca dowódcy okrętu – ppor. mar. Zbigniew Mielczarek oficer wachtowy – bosm. pchor. Zbigniew Sokołowski
ORP „Rybitwa” („R”, 21 XII 1935) dowódca okrętu – kpt. mar. Kazimierz Miładowski zastępca dowódcy okrętu – ppor. mar. Mieczysław Wróblewski oficer wachtowy – bosm. pchor.