Zmiany Wersja New Nintendo 3DS wprowadza wiele oczekiwanych zmian i ulepszeń: dodano triggery ZL i ZR dodano drugą gałkę analogową inspirowaną C-Stickiem z konsoli GameCube wprowadzono możliwość wymiany paneli na górze i dole obudowy (nie dotyczy wersji XL) rozmiar ekranu standardowej wersji to 3,88", a rozmiar ekranu wersji XL to 4,88" zmieniono procesor na nowszy i wydajniejszy zwiększono pamięć operacyjną z 128 MB FCRAM do 256 MB FCRAM, a także 6 MB VRAM podniesiono do 10 MB VRAM dodano port NFC umożliwiający odbieranie wiadomości z figurek „” produkcji Nintendo tryb 3D jest teraz widoczny pod większymi kątami, dzięki technologii śledzenia głowy gracza
Kompatybilność Konsola jest kompatybilna z wszystkimi grami na konsolę Nintendo DS oraz Nintendo 3DS. Istnieją również już takie gry, które obsłużą tylko New 3DS. Dodatkowo konsola miała dostęp do internetowego sklepu eShop, który zawierał gry ze starszych konsol Nintendo w usłudze Virtual Console.
New Nintendo 3DS XL Powiększony wariant modelu New Nintendo 3DS. Wprowadzono w nim analogiczne zmiany jak w standardowym modelu. W odróżnieniu od niego powiększony model nie ma wymiennych paneli dotykowych.