W 1641 otrzymał nominację na biskupstwo kujawskie, za wstawiennictwem królowej. W 1642 nominacja została potwierdzona przez papieża Urbana VIII. Ingres odbył 2 lutego 1643. Jako biskup większość czasu spędzał przy gdańskim kościele dominikanów i prowadził działalność kontrreformacyjną na ziemi lęborskiej i bytowskiej. Był fundatorem kilku klasztorów w diecezji, przeprowadził kilka wizytacji diecezji. W 1648 poparł kandydaturę Karola Ferdynanda na króla. Był członkiem konfederacji generalnej zawiązanej 31 lipca 1648 rokuVolumina Legum, t. IV, Petersburg 1860, s. 85.. W 1648 roku podpisał elekcję Jana II Kazimierza Wazy z województwa brzeskokujawskiegoSvffragia Woiewodztw, y Ziem Koronnych, y Wielk. Xięstwa Litewskiego. Zgodnie na Naiaśnieyszego Iana Kazimierza Obranego Krola Polskiego [...]. Dane, między Warszawą, a Wolą, Dnia 17. Listopada, Roku 1648, [b.n.s]., podpisał jego pacta conventaPorządek na seymie walnym elekcyey między Warszawą a Wolą przez opisane artykuły do samego aktu elekcyey należące, vchwalony y postanowiony roku Pańskiego M.DC.XLVIII, dnia VI października, s. 19..
Pochowany w katedrze Wniebowzięcia NMP we WłocławkuKrzysztof Rafał Prokop, Nekropolie biskupie w nowożytnej Rzeczypospolitej (XVI–XVIII w.), Kraków-Warszawa 2020, s.