Jacht był intensywnie wykorzystywany przez prezydenta Harry’ego S. Trumana, który gościł na jego pokładzie między innymi premierów Winstona Churchilla, Clementa Attleego, prezydenta Miguela Alemána Valdésa i generała George’a Marshalla. Kolejny prezydent, Dwight Eisenhower, odbył na „Williamsburgu” jedyny rejs do Yorktown, Norfolk i Annapolis. 30 czerwca 1953 roku jacht został wycofany ze służby i odstawiony w Newport. 1 kwietnia 1962 roku skreślono go z listy floty i po kilku miesiącach przekazano National Science Foundation.
thumb|240px|Kadłub „Williamsburg” w La Spezia, 2008 Nowy armator przystosował jednostkę do roli statku badawczego Instytutu Oceanografii w Woods Hole (Woods Hole Oceanographic Institution), nadając mu nazwę „Anton Bruun”, na cześć zmarłego rok wcześniej duńskiego oceanografa i ichtiologa Antona Frederika Bruuna. Do 1968 roku jacht był intensywnie wykorzystywany w rejsach badawczych na Oceanie Indyjskim i Pacyfiku. Poważnie uszkodzony w wyniku niekontrolowanego zatonięcia suchego doku, w którym był remontowany, został wycofany z użycia w związku z nieopłacalnością ewentualnej odbudowy.