Sezon 2007/2008 był dla niego najbardziej udany, jego zespół wygrał ligę i Puchar Słowacji, a Čišovský zdobył 6 goli w 27 meczach.
W sezonie 2008/2009 zdobył dwie bramki w rundzie eliminacyjnej Ligi Mistrzów, a następnie przeniósł się do rumuńskiego klubu FC Timiszoara, podpisując kontrakt na 3 latahttp://www.futbalportal.sk/?q=clanok/marian-cisovsky-%E2%80%93-na-ihrisku-je-dolezity-vykon-a-nie-vek/10084 (słow.).. W nowym klubie zadebiutował 13 września 2008 w meczu przeciwko Universitatea Craiova, jego klub wygrał 3-1. Niedługo po debiucie w klubie Čišovský złapał kontuzję, która wyłączyła go z gry na 7 miesięcy. W sezonie 2008/2009 zdobył wicemistrzostwo Rumunii oraz doszedł do finału Pucharu Rumunii, w którym jego zespół przegrał 0-3 z CFR Cluj. W finale zagrał cały mecz, dostał żółtą kartkę w 76 minuciehttp://www.romaniansoccer.ro/romanian_cup/2008_2009.shtml (rum.)..
Kariera w reprezentacji Čišovský był w składzie reprezentacji Słowacji U-23 na igrzyskach olimpijskich 2000. Zagrał na tym turnieju dwa mecze, zdobył bramkę samobójczą w meczu przeciwko Brazylii, który reprezentacja Słowacji przegrała 1-3https://web.archive.org/web/20090808155318/http://www.fifa.com/tournaments/archive/tournament=512/edition=3945/matches/match=20455/report.html (ang.)..