W styczniu 2021 został objęty śledztwem dotyczącym domniemanych zgwałceń i wykorzystywania seksualnego, których miał się dopuścić wobec swojego małoletniego pasierba na przestrzeni kilku lat. Impulsem do otwarcia postępowania było opublikowanie fragmentów książki La Familia Grande Camille Kouchner, pasierbicy Oliviera Duhamela. Autorka ujawniła w niej, że jej brat bliźniak miał być molestowany przez ojczyma od końca lat 80., kiedy miał 14 lat. Stwierdziła również, że wielu z ówczesnych znajomych politologa i jego żony, należących do kręgu paryskich intelektualistów, wiedziało o wykorzystywaniu seksualnym chłopca. W reakcji na książkę Oliver Duhamel stwierdził, że w obliczu ataków na swoją osobę rezygnuje z zajmowanych stanowisk akademickich, społecznych i medialnych, aby chronić instytucje, w których pracuje.
Wybrane publikacje Chili, 1974 Changer le PC?, 1979 La Gauche et la Ve République, 1980 Le pouvoir politique en France, 1991 Aux urnes, citoyens, 1993 Les démocraties, 1993 Histoire constitutionnelle de la France, 1995 Des raisons du „non”, 2005 Droit constitutionnel.