Steffen Højer (ur. 22 maja 1973 w Viborgu) – duński piłkarz występujący na pozycji napastnika, po zakończeniu kariery zawodniczej trener piłkarski.
Kariera zawodnicza Højer zawodową karierę rozpoczynał w 1992 roku w klubie Viborg FF z Superligaen. W najwyższej lidze duńskiej zadebiutował 15 sierpnia 1993 roku w przegranym 0:2 spotkaniu z Lyngby BK. W 1994 roku spadł z zespołem do 1. division, ale po roku wrócił z nim do Superligaen. Pierwszą bramkę w tych rozgrywkach zdobył 30 lipca 1995 roku w przegranym 1:4 meczu z zespołem FC Kopenhaga. W 1996 roku odszedł do Aalborga, także grającego w Superligaen. W 1999 roku zdobył z nim mistrzostwo Danii. W tym samym roku Aalborg dotarł do finału Pucharu Danii, jednak uległ tam 1:2 Akademisk BK.
W kwietniu 1999 roku Højer ponownie został zawodnikiem Viborga, natomiast latem tego samego roku przeszedł do włoskiej Brescii z Serie B. Spędził w tym zespole pół roku. W tym czasie nie rozegrał żadnego spotkania. Na początku 2000 roku wrócił do Danii, gdzie podpisał kontrakt z FC Midtjylland. W sezonie 1999/2000 wywalczył z klubem awans do Superligaen.