15. 1900 – zmiana nazwy na "Muzeum Dworu Cesarskiego w Kioto." 1924 – przekazanie muzeum miastu Kioto i zmiana nazwy na "Muzeum Daru Cesarskiego w Kioto" 1952 – odpowiedzialność za zbiory przejmuje rządowy Komitet Ochrony Dóbr Kultury (Committee for the Preservation of Cultural Properties), zmiana nazwy na "Muzeum Narodowe w Kioto" 1966 – ukończenie sali wystawowej 1969 – Gmach Wystaw Specjalnych, Brama Główna, kasa biletowa i ogrodzenia uznane za dziedzictwo kulturowe Japonii pod dawną nazwą "Muzeum Cesarskie w Kioto" 1973 – pierwsza sesja cyklu Wykładów Sobotnich 1979 – ukończone Centrum Ochrony Dóbr Kultury (Conservation Center for Cultural Properties) 2001 – rekonstrukcja Bramy Południowej w ramach obchodów stulecia 2007 – włączenie do Independent Administrative Institution National Institutes for Cultural HeritageIAI National Institutes for Cultural Heritage. (2007). Outline, PDF/p. 5.
Gmachy Muzeum składa się z wielu budynków, z których najważniejsze to Gmach Wystaw Specjalnych (Special Exhibition Hall) z 1895 (architekt: Katayama Tōkuma) oraz Gmach Zbiorów (The Collections Hall) z 1966 (architekt: Morita Keiichi).