Silnik również odchudzono. Zastosowano magnezowe pokrywy silnika oraz mniejszy alternator z magnesami neodymowymi. Tłoki pokryto powłoką molibdenową. Zwiększono precyzję działania skrzyni biegów. W układzie wtryskowym zastosowano lżejsze plastikowe przewody paliwowe oraz nowy zawór IACV zapewniający płynniejszą reakcję na otwarcie przepustnic. Zwiększono objętość filtra powietrza o 0.7 l. Wprowadzono czujnik spalania stukowego. Nowy układ wydechowy wyposażono w zawór sterujący przepływem spalin. W zawieszeniu zastosowano elektronicznie sterowany amortyzator skrętu (HESD), pochodzący od modelu CBR 1000RR Fireblade. Zwiększono długość tylnego wahacza. W trosce o komfort podniesiono manetki wyżej o 10 mm.
W modelu 2008 wprowadzono jedynie nowe malowanie motocykla.
PC40 (2009 - 2011) thumb|Honda CBR 600RR z 2010 roku W 2009 roku wprowadzono jako opcję system układu hamulcowego Combined ABS. Zmieniono dolną owiewkę silnika. Wprowadzono nowe malowania motocykla. Poprawiono elastyczność silnika dzięki zmianom w tłokach, głowicy i układzie wydechowym. Tłumik wydechu wykonano z tytanu.
Modele 2010 i 2011 różnią się jedynie malowaniem motocykla.
(2012) Jedyną nowością jest malowanie motocykla: biało-czerwone oraz czarne.