Motocyklowe Grand Prix Japonii 1999 – druga eliminacja Motocyklowych Mistrzostw Świata, rozegrana 23 - 25 kwietnia 1999 na torze Twin Ring Motegi w Motegi.

Wyniki 500 cm³

Pozycja Motocyklista Motocykl Czas / Strata Punkty 1 Kenny Roberts Jr. Suzuki 51.54,386 25 2 Michael Doohan Honda +2,487 20 3 Norifumi Abe Yamaha +21,758 16 4 Àlex Crivillé Honda +23,610 13 5 Sete Gibernau Honda +23,984 11 6 Carlos Checa Yamaha +37,480 10 7 Shin’ichi Itō Honda +50,582 9 8 Alex Barros Honda +52 8 9 Max Biaggi Yamaha +53,524 7 10 Nobuatsu Aoki Suzuki +1:05,068 6 11 Juan Borja Honda +1:08,314 5 12 Yukio Kagayama Suzuki +1:13,299 4 13 Noriyasu Numata Muz-Weber +1:19,245 3 14 José Luis Cardoso TSR-Honda +1:26,998 2 15 Tadayuki Okada Honda +1:30,225 1 16 Sébastien Gimbert Honda +1:52,896 17 Markus Ober Honda +1 okr. 18 Michael Rutter Honda +1 okr. 19 Mike Hale Modenas +1 okr. NS Tetsuya Harada Aprilia wycofał się NS Jurgen van den Goorbergh Muz-Weber wycofał się NS John Kocinski Honda wycofał się NS Simon Crafar Yamaha wycofał się NS Haruchika Aoki TSR-Honda wycofał się NS Jean-Michel Bayle Modenas wycofał się NS Régis Laconi Yamaha wycofał się