Przyjaciele i współpracownicy Bhutto nie wierzą w oficjalną wersję przedstawioną przez władze. Utrzymują, że Bhutto zmarła wskutek podwójnego postrzału. Farooq Naik, wysoki rangą przedstawiciel PPL, określił wyjaśnienia MSW jako „twierdzenia pozbawione podstaw” oraz jako „stek kłamstw”„Informacje na temat Bhutto to „stek kłamstw”, Onet.pl, 28 grudnia 2007. Link sprawdzony 2007-12-29.„Współpracownik Bhutto oskarża rząd o kłamstwa”, Gazeta.pl, 28 grudnia 2007. Link sprawdzony 2007-12-29..
Życie prywatne Benazir Bhutto 18 grudnia 1987 poślubiła w Karaczi Asifa Ali Zardariego. W 1988 urodziła jedynego syna Bilawala, a następnie dwie córki: Bakhtwar i Aseefę. Rodzina mieszkała w Dubaju. Syn Bilawal Zardari po śmierci matki zastąpił ją na stanowisku przewodniczącego PPL. Jej mąż 9 września 2008 został prezydentem Pakistanu.
Urodzenie w 1988 Bilawala sprawiło, że Benazir stała się pierwszą (i aż do 2018 i narodzin córki nowozelandzkiej premier Jacindy Ardern, jedyną) kobietą, która urodziła dziecko podczas pełnienia funkcji szefa rządu.