Po podjęciu decyzji o przejściu lotnictwa republiki na samoloty odrzutowe od roku 2015, w bazie Cerklje podjęto kolejne prace restrukturyzacyjne.
W roku 2007 słoweńskie ministerstwo obrony testowało w bazie Cerklje samoloty transportowe CASA C-295 i C-27J Spartan. Wybrano dwa samoloty Casa C-295; pierwszy z nich miał być dostarczony w roku 2008, drugi w 2010. Zamówienie na pierwszy zostało złożone w styczniu 2008 roku, ale w lutym program sprzedaży hiszpańskich samolotów został zamrożony w związku z tragiczną katastrofą w Mirosławcu, w której zginęło dwudziestu polskich wojskowych. Słowenia planuje ponowne starania o nabycie nowych samolotów transportowych w roku 2012.
Zadania Zadaniem sił powietrznych i obrony przeciwlotniczej jest zapewnienie bezpieczeństwa przestrzeni powietrznej Republiki Słowenii (przy wsparciu lotnictwa włoskiego, a także zapewnianie wsparcia lotniczego siłom lądowych i nawodnych w wykonywaniu ich zadań w ramach operacji połączonych.