W czasie Sonderaktion Krakau Max Vasmer oraz m.in. Bernd von Arnim, Max von Laue czy Otto Hahn wstawili się za aresztowanymi polskimi kolegami w Urzędzie Spraw Zagranicznych i innych urzędach w BerlinieErnst-August Seyfarth, Henryk Pierzchała, Prześladowanie polskich naukowców, „Alma Mater” numer specjalny 64 (2004)..

Po wojnie, w semestrze zimowym 1946/47, Vasmer podjął ponownie wykłady na Uniwersytecie Humboldta w Berlinie. Po profesurze na Uniwersytecie w Sztokholmie 1947/48Barbro Nilsson, Institutionen för slaviska och baltiska språk vid Stockholms universitet, 50 år, 2007-05-28 . wrócił do Berlina Zachodniego, gdzie od 1949 roku aż do swojego przejścia na emeryturę w 1956 roku wykładał na Wolnym Uniwersytecie Berlina.

Osiągnięcia Choć w 1944 roku dom Vasmera w Berlinie został zbombardowany, a większość jego materiałów zginęła lub została zniszczona, Vasmer nie poddał się i ostatecznie dzieło jego życia zostało opublikowane w czterech tomach na Uniwersytecie w Heidelbergu w latach 1950–1958 jako Russisches Etymologisches Wörterbuch. Rosyjskie tłumaczenie słownika z obszernym komentarzem Olega Trubaczowa (Олег Николаевич Трубачёв) zostało wydrukowane w latach 1964–1973.