W fazie playoff nie zagrał w żadnym meczu.
Na początku lipca 2009 roku Flyers pozyskali dwóch bramkarzy: Ray Emery i Brian Boucher, praktycznie zapewniając niepodpisanie kontraktu z Niittymäkim na kolejny sezon. Niittymäki został wolnym agentem. W połowie lipca podpisał kontrakt z Tampa Bay Lightning jako zastępca Mike’a Smitha.
Sezon 2009/2010 rozpoczął wielkim sukcesem. Po pierwszych dziesięciu meczach prowadził w lidze w statystykach średniej obronionych strzałów jak i współczynniku GAA. Ostatecznie rozegrał dla drużyny z Florydy 49 spotkań z których wygrał 21. Po sezonie zakończył współpracę z Błyskawicami. 1 lipca 2011 roku podpisał dwuletni kontrakt z San Jose Sharks, który gwarantuje mu 4 miliony dolarów.
W sierpniu powrócił do ojczyzny i został ponownie zawodnikiem macierzystego klubu TPS, w barwach którego uczestniczył w sezonie SM-liiga (2012/2013). W jego trakcie rozegrał jedynie 14 spotkań. W kwietniu 2013 roku zakończył karierę zawodniczą z powodu kontuzji biodra.