W 2015 przystąpił do nowo powstałej partii Jedność Narodu (zasiadał w jej radzie krajowej). Jako jej działacz w tym samym roku został zarejestrowany jako lider listy KWW Grzegorza Brauna „Szczęść Boże!” do Sejmu w wyborach parlamentarnych, jednak lista ta została przed wyborami wyrejestrowana. W 2017 JN została wykreślona z ewidencji partii.
Został przewodniczącym rzeszowskiego oddziału Polskiego Towarzystwa Geopolitycznego, przewodniczącym Komisji Obrony Terytorialnej PTG, a także wykładowcą Uniwersytetu Rzeszowskiego oraz Wyższej Szkoły Prawa i Administracji w Przemyślu.
W wyborach w 2018 Andrzej Zapałowski uzyskał mandat radnego Przemyśla z listy ugrupowania Kukiz’15. Do czerwca 2020 był wiceprzewodniczącym rady miasta. W wyborach do Parlamentu Europejskiego w 2019 z rekomendacji Federacji dla Rzeczypospolitej znalazł się na liście kandydatów Konfederacji, która nie osiągnęła progu wyborczego.
Następnie związany był z Konfederacją Korony Polskiej (do 2025). W wyborach parlamentarnych w tym samym roku był liderem listy Konfederacji do Sejmu w okręgu krośnieńskim;