Dorobek naukowy Większość prac Proskauera dotyczyła zagadnień oczyszczania ścieków i dezynfekcji wody. Wspólnie z Vogesem opracował test na obecność acetoiny w kulturach bakterii, tzw. test Vogesa-Proskauera, mający do dziś znaczenie w identyfikacji przedstawicieli Enterobacteriaceae. Proskauer i Achille Capaldi jako pierwsi opisali w 1896 redukcję molibdenianiu do błękitu molibdenowego przez E. coli.
Przez wiele lat współpracował z redakcją „Chemisches Zentralblatt”. Razem z Richardem Pfeifferem był redaktorem dwutomowej encyklopedii higieny (Encyklopädie der Hygiene, 1902-1905).
Wybrane prace Beiträge zur Bestimmung der schwefligen Säure in der Luft. Mittheilungen aus dem kaiserlichen Gesundheitsamte 1, ss. 1-18, 1881 Fischer B, Proskauer B. Ueber die Desinfection mit Chlor und Brom. Mittheilungen aus dem kaiserlichen Gesundheitsamte 2, ss. 228-308, 1884
Pfeiffer R, Proskauer B. Beiträge zur Kenntnis der spezifisch wirksamen Körper im Blutserum von choleraimmunen Tieren. Centralblatt für Bakteriologie 19, ss. 191-199, 1896