Struktura oparta na instytutach została zmieniona w 1992. Z czterech wyżej wymienionych instytutów powstało dziesięć katedr i zakładów. W tym samym roku wydział przyjął kolejną nazwę – Wydział Geologii, Geofizyki i Ochrony Środowiska.
Struktura Wydział składa się z następujących jednostek: Katedra Geologii Ogólnej i Geoturystyki Katedra Ochrony Środowiska Katedra Mineralogii, Petrografii i Geochemii Katedra Geologii Złożowej i Górniczej Katedra Analiz Środowiskowych, Kartografii i Geologii Gospodarczej Katedra Surowców Energetycznych Katedra Geofizyki Katedra Hydrogeologii i Geologii Inżynierskiej Katedra Geoinformatyki i Informatyki Stosowanej Laboratorium Wydziałowe Muzeum Geologiczne
Do wydziału należy również Ośrodek Szkoleniowo-Dydaktyczny w Miękini.
Władze Dziekan: prof. dr hab. Ewa Kmiecik Prodziekan ds. Nauki: dr hab. inż. Paulina Krakowska-Madejska, prof. AGH Prodziekan ds. Współpracy: dr hab. inż. Mariusz Młynarczuk, prof. AGH Prodziekan ds. Ogólnych i Studenckich dla studentów studiów stacjonarnych kierunków Geoinformatyka, Inżynieria i Analiza Danych oraz studentów obcokrajowców: dr inż.