Podegrodzie graniczy z: od północy z Mokrą Wsią i Gostwicą; od północnego wschodu ze Stadłami; od północnego zachodu z Rogami; od południa z Naszacowicami; Od południowego wschodu ze Starym Sączem i na niewielkim odcinku z Mostkami; Od zachodu z Juraszową.
Części wsi +Integralne części wsi Podegrodzie SIMC Nazwa Rodzaj0460931 Barcynka część wsi0460948 Buczkówka część wsi0460954 Góra-Wieś część wsi0460977 Kąty część wsi0460983 Kolonie część wsi0460990 Łazy Podegrodzkie część wsi0461014 Niżne Pole część wsi0461020 Osieki część wsi0461095 Osowie przysiółek0461037 Pędzicha część wsi0461043 Stolica część wsi0461066 U Wody część wsi
Rzeźba terenu Wzgórza znajdujące się we wschodniej części wsi wytworzyły się w trzeciorzędzie. Skały te zwane są fliszem karpackim. Pozostała część miejscowości zbudowana jest na schodowato ułożonych terenach. O rzeźbie terenu Podegrodzia i całej gminy zadecydowały ruchy górotwórcze, czynniki rzeźbiące w epoce lodowcowej oraz erozja brzegów strumieni i potoków przez wody nimi spływające. Okoliczne wzgórza charakteryzują się łagodnością grzbietów.