Jérôme Bonnissel (ur. 16 kwietnia 1973 w Montpellier) – piłkarz francuski grający na pozycji lewego obrońcy.
Kariera klubowa Karierę piłkarską Bonnissel rozpoczął w klubie Montpellier HSC. W 1992 roku awansował do kadry pierwszego zespołu Montpellier. 17 stycznia 1993 zadebiutował w jego barwach w Ligue 1 w zremisowanym 0:0 wyjazdowym meczu z Lille OSC. W 1994 roku wystąpił z Montpellier w przegranym 0:3 finale Pucharu Francji z AJ Auxerre. W Montpellier grał do końca sezonu 1995/1996.
Latem 1996 Bonnissel przeszedł z Montpellier do hiszpańskiego klubu Deportivo La Coruña. 30 sierpnia 1996 zadebiutował w Primera División w zremisowanym 1:1 domowym meczu z Realem Madryt. W zespole Deportivo grał przez trzy sezony. W 1999 roku wrócił do Francji i został zawodnikiem Girondins Bordeaux. W Bordeaux występował przez 3,5 roku.
W 2003 roku Bonnissel został piłkarzem szkockiego Rangers, z którym wiosną zdobył Puchar Ligi Szkockiej, a także wywalczył mistrzostwo Szkocji. Latem tamtego roku odszedł do angielskiego Fulham. 16 sierpnia 2003 zanotował swój debiut w Premier League – w meczu z Middlesbrough (3:2). Zawodnikiem Fulham był do 2005 roku.