A Fender Bender zawierał piosenki „Monster” i „Indiana”, które były także częścią nadchodzącego albumu. Pełny krążek został wydany 8 sierpnia 2006 roku. Something Real zawierał nowe nagrania i opracowane na nowo, akustyczne piosenki z płyty Our Home is Gone. Utwory „Indiana”, „Masterpiece” i „Nineteen Stars” zostały nagrane ponownie, tym razem z pełnym zespołem, a część kompozycji „Timmy” została użyta w piosence „Roses”.
We wrześniu 2006 roku, na stronie zespołu Meg & Dia w serwisie Myspace ukazała się informacja, że Kenji Chan odchodzi z kapeli, by skupić się na swojej solowej karierze. Zastąpił go kanadyjski gitarzysta Carlo Gimenez, którego siostry odkryły na YouTube.
Here, Here and Here Album Here, Here and Here został wydany 21 kwietnia 2009 roku, ponad rok po tym, jak został nagrany. Sprzedawany był w trzech formatach: na CD, w pakiecie CD+DVD oraz na płytach winylowych. Jest to pierwsza płyta zespołu po podpisaniu kontraktu z Warner Bros. i pierwsza nagrana w dzisiejszym składzie. Muzycznie, album różni się od wcześniejszych dokonań kapeli, głównie w związku z eksperymentami z nowymi instrumentami (smyczki, syntezatory, harmonijka i alternatywne instrumenty perkusyjne) i udziałem gościnnego wokalisty (Tom Higgenson w "Bored Of Your Love").