(L1) Molde FK (L1) Ekranas Poniewież (L1) Budućnost Podgorica (L1) Red Bull Salzburg (L1) Partizan Belgrad (L1) FK Ventspils (L1) Skënderbeu Korcza (L1) AEL Limassol (L1) Helsingborgs IF (L1) Zestaponi (L1) Flora Tallinn (L1) Łudogorec Razgrad (L1) FK Željezničar (L1) Neftçi PFK (L1) The New Saints F.C. (L1) Dinamo Zagrzeb (L1) HJK Helsinki (L1) NK Maribor (L1) Ulis Erywań (L1) BATE Borysów (L1) Shamrock Rovers (L1) Wardar Skopje (L1)I runda kwalifikacyjna Valletta FC (L1) HB Tórshavn (L1) FC Lusitanos (L1) Linfield F.C. (L1) F91 Dudelange (L1) SP Tre Penne (L1)
Terminarz meczów Faza Runda data losowania Pierwszy mecz Rewanż Kwalifikacje I runda kwalifikacyjna 25 czerwca 2012 3–4 lipca 2012 10–11 lipca 2012 II runda kwalifikacyjna 17–18 lipca 2012 24–25 lipca 2012 III runda kwalifikacyjna 20 lipca 2012 31 lipca–1 sierpnia 2012 7–8 sierpnia 2012 Play-off Runda Play-off 10 sierpnia 2012 21–22 sierpnia 2012 28–29 sierpnia 2012 Faza grupowa 1 dzień rozgrywek 31 sierpnia 2012(Monako) 18–19 września 2012 2 dzień rozgrywek 2–3 października 2012 3 dzień rozgrywek 23–24 października 2012 4 dzień rozgrywek 6–7 listopada 2012 5 dzień rozgrywek 20–21 listopada 2012 6 dzień rozgrywek 4–5 grudnia 2012 Faza pucharowa 1/8 finału 20 grudnia 2012 12–13 & 19–20 lutego 2013 5–6 & 12–13 marca 2013 Ćwierćfinały 15 marca 2013 2–3 kwietnia 2013