2000 Jeppesen zakupił Nobeltec Inc. z Portland dostarczającą morskie oprogramowanie nawigacyjne i mapy. Boeing wykupił Jeppesena od Tribune, które weszło w posiadanie Times Mirror i sprzedawało swoje dodatkowe aktywa.
2002 Pierwsze komercyjne Electronic Flight Bags zostały wypuszczone na rynek. Jeppesen udostępnił również możliwość dostawy swoich elektronicznych map przez Internet.
2003 Jeppesen, jako pierwsza organizacja handlowa, został uznany przez FAA za Wykwalifikowanego Dostawcę Usług Komunikacyjnych w Internecie (Qualified Internet Communications Provider).
2004 Jeppesen wszedł w posiadanie SBS International, nowojorskiego dostawcę usług planowania załogi. Zakup SBS został dokonany w porozumieniu z Boeing, który nabył SBS w 2001 roku.
2006 Jeppesen przejął Carmen Systems, dostawcę oprogramowania do planowania załogi i zarządzania zakłóceniami w trakcie lotu. Główną siedzibą około 300-osobowej firmy był Göteborg w Szwecji. Jeppesen szybko scalił ofertę i lokacje SBS wraz z Carmen Systems.