Shion (jap. 紫苑(シオン) - łac. aster tataricus) to inteligentny, uporządkowany chłopak, który w przyszłości miał przystąpić do specjalnego programu nauczania dla wybitnych uczniów specjalizujących się w dziedzinie ekologii. Jednakże jego przeznaczenie zmieniło się przez znaczące spotkanie z Nezumim. Mimo iż Shion wiedział, że chłopiec ten jest poszukiwanym przestępcą, opatrzył jego ranę postrzałową, nakarmił go i pozwolił mu spędzić noc w jego pokoju. Nezumi zniknął jednak następnego dnia.

Podczas policyjnego śledztwa Shion został osądzony o umyślne ukrywanie przestępcy, dlatego odebrano mu status elity (jako iż żyli w społeczeństwie opartym na kastach). Shion wraz z matką byli zmuszeni do opuszczenia domu przeznaczonego dla elity w Chronosie i wprowadzenia się do mieszkania w Utraconym Mieście. Shionowi odebrano również szansę przystąpienia do specjalnego programu nauczania. Cztery lata później Shion, już jako szesnastolatek, pracuje dla Zarządu Parku No.6, gdzie jego zadaniem jest pilnowanie robotów sprzątających. Pewnego dnia Shion i jego współpracownik zauważają w parku martwego starca. Gdy sprawa nie zostaje ujawniona w wiadomościach, a ów starzec w momencie śmierci był 31-letnim mężczyzną, Shion zaczyna podejrzewać rząd o zatajanie informacji.