Garin, Kristoffer (August 19, 2001). „Jeter Sweeter A-Rod says OK as ex-date is seen with Yankee star”. New York Daily News. Retrieved July 18, 2009. i aktorką Jordaną Brewster„Sports Beat”. Sports Illustrated. July 15, 2002. Retrieved July 18, 2009.. Dodatkowo w latach 2003–2006 widywany był z prezenterką Vanessą Minillo. Od listopada 2006 do stycznia 2007 zamieszany był w romans z aktorką Jessicą BielReardanz, Karen (November 16, 2006). „Biel Dating Jeter?”. San Francisco Chronicle. Retrieved November 16, 2006.„The Women of Derek Jeter”. ESPN.com. November 18, 2006. Retrieved October 4, 2009.. W 2008 roku spotykał się z gwiazdą Fright Night Lights Minką Kelly„Derek Jeter talks Minka Kelly (sort of)”. Sports Illustrated. October 28, 2008. Retrieved July 18, 2009.. 9 lipca 2016 poślubił modelkę Hannah Davis, z którą spotykał się od 2012. Mają dwie córki: Bellę Raine (ur. 17 sierpnia 2017) oraz Story Grey (ur. 31 stycznia 2019).
W grudniu 2002 właściciel drużyny George Steinbrenner skrytykował Jetera za przebywanie na przyjęciu urodzinowym do 3 nad ranem podczas sezonu 2002, wypowiadając się na ten temat swojego shortstop, że: „nie był w pełni skupiony” oraz że „to nie było z pozytywnym skutkiem” dla zawodnika.