Nicolai Jørgensen (ur. 15 stycznia 1991 w Ballerup) – piłkarz duński grający na pozycji napastnika.
Kariera klubowa Karierę piłkarską Jørgensen rozpoczął w klubie Skovlunde IF. Trenował też w juniorach Brøndby IF, a następnie w Akademisk BK. W 2009 roku awansował do kadry pierwszej drużyny Akademisk BK, w sezonie 2008/2009 zadebiutował w jego barwach w duńskiej 1. Division. W sezonie 2009/2010 był podstawowym zawodnikiem klubu.
W lipcu 2010 roku Jørgensen podpisał 5-letni kontrakt z niemieckim Bayerem 04 Leverkusen. W Bundeslidze zadebiutował 29 sierpnia 2010 roku w przegranym 3:6 domowym meczu z Borussią Mönchengladbach, gdy w 63. minucie zmienił Tranquilla Barnettę. W sezonie 2010/2011 rozegrał w Bundeslidze 9 meczów. Wiosną 2012 był wypożyczony do 1. FC Kaiserslautern.
Latem 2012 roku Jørgensen przeszedł do FC København. Zadebiutował w tym zespole 15 lipca 2012 w wygranym 4:2 domowym meczu z FC Midtjylland. W sezonach 2012/2013 oraz 2015/2016 wywalczył mistrzostwo Danii, a w sezonach 2014/2015 i 2015/2016 puchar kraju.