Historia Lotnisko Nowy Sącz-Łososina Dolna powstało w 1960 roku dzięki staraniom władz PRL i Aeroklubu Podhalańskiego. Płyta lotniska została wykonana przez Wojska inżynieryjne. 18 września 1960 roku ówczesny dowódca Wojsk Lotniczych i Obrony Przeciwlotniczej Obszaru Kraju, generał Jan Frey-Bielecki przekazał podczas oficjalnego otwarcia lotnisko do użytkowania Aeroklubowi Podhalańskiemu.
Od czasu wybudowania lotniska nieprzerwanie działalność tu prowadzi Aeroklub Podhalański. Odbywały się tu w 1979 roku Międzynarodowe Zawody Modelarskie, a w 1983 roku Mistrzostwa Świata w Modelarstwie Rakietowym pod patronatem i z udziałem jedynego polskiego kosmonauty Mirosława Hermaszewskiego.
Kierownikami lotniska byli od 1960 roku Jerzy Iszkowski, a po jego śmierci w 1962 roku następcą został Leopold Kwiatkowski. Od 1968 roku do 1972 roku kierownikiem lotniska był Tadeusz Złotowski, a od 1973 roku do 1991 roku dyrektorem był Józef Smaga. Od roku 1993 do 2009 funkcję dyrektora pełnił Stanisław Filipek. Następnym dyrektorem od 2009 do 2016 roku został Roman Matyjewicz, a po nim funkcję przejął Roman Filipek, który pełnił ją do 2018 roku. Od 2018 dyrektorem jest Piotr Wszołek. Lotnisko utrzymywane jest z pieniędzy pozyskiwanych m.in.