Życie prywatne Moore był żonaty z Phyllis Moore, z którą ma dwie córki: Leah (ur. 1978) i Amber. Od 2007 jego żoną jest artystka Melinda Gebbie, z którą współtworzył Zagubione dziewczęta. Mieszka w Northampton, rzadko opuszczając rodzinne miasto. W 2007 wystąpił gościnnie w serialu The Simpsons (odcinek Husbands and Knives) obok Arta Spiegelmana i Daniela Clowesa.
Poglądy Okultyzm i religia W 1993, w dniu swoich czterdziestych urodzin, Alan Moore otwarcie ogłosił, że poświęca się praktykowaniu magii ceremonialnej, co – jak sam stwierdził – postrzegał jako „logiczny końcowy etap mojej kariery pisarskiej”. Inspiruje się m.in. postacią renesansowego maga Johna Dee, astrologa królowej Elżbiety I.
Według wywiadu z 2001, inspiracją do tego kroku była praca nad komiksem Prosto z piekła na początku lat 90., w którym pojawia się wiele symboli masońskich i okultystycznych. Moore wspominał:
Moore bardzo silnie łączy pojęcie magii z twórczością artystyczną: Podejmując studia nad kabałą i pismami wczesnodwudziestowiecznego okultysty Aleistera Crowleya, Moore przyjął niektóre idee z jego religii Thelemy, w tym przekonanie, że Prawdziwa Wola (ang.