Pomimo zwolnienia z aresztu części duchownych po kilku miesiącach od aresztowania, członkowie zboru Zjednoczenia Kościołów Chrystusowych w Gdańsku nie zostali objęci przez nich ponownie opieką duszpasterską, w związku z czym przyłączyli się do miejscowych zborów Związku Chrześcijan Wiary Ewangelicznej oraz Kościoła Chrześcijan Baptystów, a ich dotychczasowa wspólnota zanikła. Odbudowa kościoła przy ul. Mennonitów 2 została podjęta na nowo w późniejszych latach przez Zjednoczony Kościół Ewangeliczny, po wejściu Zjednoczenia Kościołów Chrystusowych w skład tego związku wyznaniowego.
W wyniku reorganizacji Zjednoczonego Kościoła Ewangelicznego i usamodzielnieniu się wchodzących w jego skład ugrupowań, w tym Kościoła Zborów Chrystusowych, zdecydowano o wznowieniu działalności zboru tej denominacji na terenie Trójmiasta. Dzięki wsparciu Pawła Bajko i organizacji „Department of Mission” ze Stanów Zjednoczonych, w 1986 będący w fazie przekształceń Zjednoczony Kościół Ewangeliczny dokonał zakupu posesji przy ul. Oficerskiej 15 w Gdyni, na którą składała się działka o powierzchni 1870 m² z piętrowym domem. Rozpoczęta została jego przebudowa na cele sakralne, powstało w nim również mieszkanie dla pastora. W kwietniu 1987 z Olsztyna do Gdyni przeniósł się Sergiusz Kobus, który został pastorem rodzącej się wspólnoty.