Zadania 3 Skrzydło Lotnictwa Transportowego wykonuje loty w czasie pokoju, kryzysu i wojny, dostarczając żołnierzy, zaopatrzenie i pomoc. Prowadzi szeroki zakres działań, które obejmują:
• Zadania wojskowego transportu lotniczego żołnierzy i ładunków (oraz nadzwyczajnie loty HEAD);
• Zabezpieczenie transportu lotniczego;
• Lotniczy system poszukiwawczo-ratowniczy, lotnicze ewakuacje medyczne;
• Wsparcie lotnicze Wojsk Specjalnych, Wojsk Lądowych (operacji specjalnych oraz powietrznodesantowych);
• Loty ekstradycyjne np. na rzecz Policji;
• Udział w pomocy humanitarnej;
• Udział w Akcjach Serce (loty transplantacyjne organów);
Dowódcy skrzydła maj 2007 – sierpień 2007 – gen. bryg. pil. Sławomir Kałuziński 2007–2008 – gen. bryg. pil. Adam Świerkocz 2008–2011 – gen. bryg. pil. Tadeusz Mikutel 2011–2014 – płk dypl. pil. Sławomir Żakowski 2014–2015 – gen. bryg. pil. Mirosław Jemielniak 2015–2019. – gen. bryg. pil. Krzysztof Walczak 2019–01.12.2020 – gen. bryg. pil. dr inż. Krzysztof Cur 01.12.2020–15.05.2023 – gen. bryg. pil. Wojciech Pikuła 15.05.2023 – gen. bryg. pil.