Tam w jesiennym sezonie Apertura 2012 wywalczył tytuł wicemistrza kraju, jednak pozostawał głębokim rezerwowym drużyny i rozegrał zaledwie jedno spotkanie w lidze.
Po powrocie do Atlasu, w sezonie Apertura 2013, Paganoni dotarł z nim do finału krajowego pucharu – Copa MX, lecz nie potrafił sobie wywalczyć miejsca w pierwszej jedenastce i nie został nawet zgłoszony do rozgrywek ligowych. W lipcu 2014 został wypożyczony do drugoligowego Irapuato FC, gdzie jako podstawowy piłkarz grał przez pół roku, po czym powrócił do pierwszej ligi, na zasadzie wypożyczenia zasilając Tiburones Rojos de Veracruz. Tam od razu został kluczowym graczem linii obrony i już po upływie sześciu miesięcy dołączył do Veracruz na stałe. W wiosennym sezonie Clausura 2016 wywalczył z Veracruz puchar Meksyku.
Sezon Klub Kraj Rozgrywki Mecze Bramki 2006/2007 Club Atlas
Liga MX 2 0 2007/2008 Académicos de Tonalá
Ascenso MX 21 0 2008/2009 Club Atlas
Liga MX 14 0 2009/2010 Club Atlas
Liga MX 5 1 2010/2011 Club Atlas
Liga MX 22 0 2011/2012 Club Atlas
Liga MX 23 0 2012/2013 Deportivo Toluca
Liga MX 1 0 2012/2013 Club Atlas
Liga MX 1 0 2013/2014 Club Atlas
Liga MX 0 0 2014/2015 Irapuato FC
Ascenso MX 13 0 2014/2015 Tiburones Rojos de Veracruz