W swoim drugim sezonie, Asik ponownie zagrał we wszystkich meczach. Dwukrotnie wyszedł nawet w pierwszej piątce. Co prawda nie udało mu się ani razu uzyskać double-double, ale był ważnym zawodnikiem rotacji Chicago Bulls. Swoje średnie podniósł w drugim sezonie do 3,1 punktu, 5,3 zbiórki i 1,0 bloku podczas 14,7 minuty gry. W play-off w obliczu kontuzji Joakima Noah wszedł w trzecim meczu do pierwszej piątki i grał w niej w pozostałych czterech spotkaniach. W ostatnim, szóstym spotkaniu spudłował dwa bardzo ważne rzuty wolne w samej końcówce, po których Philadelphia 76ers przejęła kontrolę nad meczem i wyeliminowała Bulls.
Houston Rockets 20 lipca 2012 roku podpisał trzyletni kontrakt z Houston Rockets, wart 25 milionów dolarów. W nowej drużynie zagrał ponownie we wszystkich meczach sezonu, tym razem w każdym wychodził w pierwszej piątce. 10 grudnia w meczu przeciwko San Antonio Spurs pierwszy raz w karierze przekroczył granicę 20 punktów, zdobywając ich 21. 18 stycznia 2013 w sptkaniu z Indiana Pacers poprawił ten rekord, rzucając 22 punkty. Wynik ten wyrównał 1 kwietnia w meczu przeciwko Orlando Magic. Z kolei 27 lutego zanotował 22 zbiórki przeciwko Milwaukee Bucks. W sezonie zanotował aż 33 razy double-double, kończąc rozgrywki ze średnimi na takim poziomie – 10,1 punktu i 11,7 zbiórki na mecz.