Jego obiecującą karierę zawodniczą przerwała seria poważnych kontuzji.
Kariera zawodowa Po ukończeniu studiów w 1973 rozpoczął pracę trenera młodzieży w warszawskim klubie Orzeł. Od 1978 pracował w AZS AWF Warszawa, a dodatkowo od 1979 - w nowo powstałej Szkole Mistrzostwa Sportowego im. Janusza Kusocińskiego przy ul. Zuga. Jednocześnie angażował się społecznie w pracach Komisji Młodzieżowej PZLA. W 1986 objął w PZLA stanowisko szkoleniowca ds. młodzieży, w 1989 - szefa szkolenia młodzieży, by w latach 1993-1996 piastować stanowisko szefa szkolenia. W 1991 awansował z trenera klasy pierwszej do klasy mistrzowskiej.
Osiągnięcia szkoleniowe Opracował i wdrożył w ośrodkach szkoleniowo-sportowych kraju kompleksowy program doboru, szkolenia i selekcji kadr młodzieży do poszczególnych dyscyplin LA. Skuteczność przyjętych rozwiązań potwierdzały wyniki polskich juniorów osiągane na mistrzostwach Europy i świata już pod koniec lat osiemdziesiątych. Z pierwszych większych zawodów przygotowanych pod jego kierunkiem - mistrzostw świata juniorów w Sudbury w Kanadzie w 1988 - ze złotymi medalami wrócili Tomasz Jędrusik (bieg na 400 metrów) i Artur Partyka (skok wzwyż), z brązowymi - Małgorzata Kiełczewska (rzut oszczepem) i Dorota Buczkowska (bieg na 800 metrów)Gazeta Wyborcza z 17 lipca 1996, "Marek Biskupski. Wspomnienia.