W 2009 roku powrócił do japońskiej F3. Startując w klasie narodowej, Sekiguchi trzykrotnie zwyciężył, ostatecznie zajmując w końcowej klasyfikacji 5. pozycję. W kolejnym sezonie brał udział w głównym cyklu. Japończyk dzięki równej i konsekwentnej jeździe, sięgnął po tytuł wicemistrzowski, ulegając jedynie dominującemu rodakowi Yūji Kunimoto. Rok później Yūhi został mistrzem serii, pomimo nie wzięcia udziału w inauguracyjnej eliminacji na torze Suzuka. W trakcie zmagań sześciokrotnie stanął na najwyższym stopniu podium.
Statystyki Sezon Seria Zespół Wyścigi PP Zwycięstwa Punkty Poz. koń. 2004 Azjatycka Formuła Renault Challenge Asia Racing Team 2 0 0 0 NS 2005 Formuła Toyota 10 0 0 68 5 2006 Formuła Toyota ? 8 ? 155 1 Japońska Formuła Challenge 10 3 3 106 1 2007 Japońska Formuła 3 Now Motorsport 20 0 0 101 7 2008 Międzynarodowa Formuła Master Euronova Racing 14 0 0 12 16 Super GT WedaSport (GT300) 1 0 0 1 31 2008–09 Azjatycka Seria GP2 David Price Racing 2 0 0 0 32 2009 Japońska Formuła 3 (klasa narodowa) Aim Sports 14 4 3 57 5 2010 Japońska Formuła 3 - klasa mistrzowska ThreeBond Racing 16 0 0 81 2 Super GT Japan - GT300 Team JLOC 7 0 0 30 9 Grand Prix Makau ThreeBond Racing 1 0 0 N/A 20 JAF Grand Prix SUPER GT & Formuła NIPPON FUJI SPRINT CUP - GT300 Class JLOC 1 0 0 0 NS 2011 Japońska Formuła 3 - klasa mistrzowska B-Max