Powrócił do aktywnej służby po wybuchu II wojny światowej, w stopniu kontradmirała (Konteradmiral), jako komendant obszarów morskich w Belgii i Holandii, następnie w Bretanii i zachodniej Francji. Awansowany 1 lutego 1941 roku do stopnia wiceadmirała (Vizeadmiral), został mianowany dowódcą obszaru południowo-wschodniego (Admiral Südost), ale przed objęciem stanowiska zginął w katastrofie lotniczej na lotnisku Le Bourget pod Paryżem. Został pochowany na Cmentarzu Inwalidów w Berlinie.
W trakcie swej służby był odznaczony między innymi: Pour le Mérite (1916), Krzyżem Żelaznym I i II klasy, Krzyżem Zasługi Wojennej, Orderem Rodu Hohenzollernów, pruskim Orderem Korony, Krzyżem Hanzeatyckim miasta Hamburga, austriackimi Orderem Leopolda, Orderem Żelaznej Korony i Krzyżem Zasługi Wojskowej oraz osmańskimi Medalem Wojennym i Medalem Imtiyaz.
Przypisy Paul G. Halpern: Arnauld de la Perière, Lothar von (1886–1941) [w:] Spencer C. Tucker (red.): Naval Warfare. An International Encyclopedia. Santa Barbara, CA: 2002. . William H. Langenberg: The U-Boat Ace of Aces. „Sea Classics”. May 2004.