Latem 2005 Hernández powrócił do swojego macierzystego Tigres UANL, w którego barwach za kadencji szkoleniowca Leonardo Álvareza zadebiutował w meksykańskiej Primera División, 20 sierpnia 2005 w zremisowanym 1:1 spotkaniu z Guadalajarą, kiedy to w 69. minucie zmienił kontuzjowanego Rogelio Rodrígueza. Od razu wygrał z nim rywalizację o miejsce w wyjściowym składzie, zostając podstawowym bramkarzem Tigres. W tej roli w styczniu 2006 triumfował w rozgrywkach kwalifikacyjnych do Copa Libertadores – InterLidze, a ogółem pewną pozycję między słupkami miał przez półtora roku; dopiero później został relegowany do roli rezerwowego na rzecz Cirilo Saucedo. W lipcu 2007 przeniósł się do ekipy Jaguares de Chiapas z siedzibą w Tuxtla Gutiérrez, gdzie początkowo był alternatywą dla Omara Ortiza, następnie przez półtora roku występował w wyjściowym składzie, aby później przegrać rywalizację z Óscarem Pérezem.