Twórczość Początkowo tworzył obrazy symboliczne, sceny baśniowe i legendarne, pracował również jako ilustrator (zamieszczał ilustracje w lwowskim dwutygodniku „Faun”, ale również ilustrował książkinp. Marjan Reiter, Czytania polskie. T. 1; z rys. Z. Ćwiklińskiego, Lwów, 1925.). Pozostawał wtedy pod wpływem Władysława Podkowińskiego. Około 1897 roku zajął się również malarstwem pejzażowym, przedstawiając okolice Lwowa. Przyjeżdżał do majątku Stanisława Hofmokla, który we wsi Zarzecze kupił majątek ziemski i dwór od państwa Kostheimów. Ćwiklińskiego urzekły krajobrazy i stara zarzecka kapliczka, „uważał bowiem Zarzecze za jeden z najpiękniejszych zakątków Polski”H. Ostrowska-Grabska, Bric a brac 1848-1939, Wrocław 1978, s. 232,. W roku 1908 zamieszkał na stałe w Zakopanem, tworząc odtąd głównie krajobrazy i motywy tatrzańskie – prezentowane na wystawach, a także popularyzowane przez wydawane pocztówki. Owe pocztówki z reprodukcjami jego obrazów, których częstym motywem były pasące się na halach owce, ugruntowały sławę Ćwiklińskiego jako malarza Tatr.