Małgorzata Ebner, właśc. niem. Margareta lub Margarete Ebner (ur. w 1291 w Donauwörth, zm. 20 czerwca 1351 w Mödingen) – bawarska mistyczka oraz dominikanka, dziewica i błogosławiona Kościoła rzymskokatolickiego.
Pochodziła z arystokratycznej rodziny. W wieku 15 lat wstąpiła do klasztoru dominikanek pod wezwaniem Wniebowzięcia NMP w Mödingen (niem. Kloster Mödingen lub Kloster Maria Medingen)Nie należy mylić Mödingen (Kloster Medingen) z inną niemiecką miejscowością Medingen. w diecezji augsburskiej. Tam ciężko zachorowała i została przykuta do łóżka. W 1332 poznała księdza Henryka z Nördlingen, swojego przewodnika duchowego, na którego polecenie zapisywała swoje mistyczne doświadczenia w dzienniku, zwanym Revelationes lub DiariumKorespondencja Henryka jest pierwszym z zachowanych zbiorów listów w języku niemieckim (za źródłem DEON.pl). Małgorzata Ebner napisała również zbiór medytacji znany jako Paternoster. Korespondowała z dominikaninem i mistykiem nadreńskim Janem Taulerem a także dominikanką i mistyczką Krystyną Ebner (zm.