Od 1 października 2019 roku głównymi jednostkami organizacyjnymi uczelni są instytuty oraz wydziały. Wydziały są odpowiedzialne za kształcenie na kierunkach studiów. Instytuty organizują działalność naukową i badawczą w ramach dyscyplin naukowych. Badania naukowe prowadzone są w następujących instytutach: Instytut Biologii Instytut Ekonomii i Finansów Instytut Informatyki Technicznej Instytut Inżynierii Lądowej Instytut Inżynierii Mechanicznej Instytut Inżynierii Środowiska Instytut Medycyny Weterynaryjnej Instytut Nauk Drzewnych i Meblarstwa Instytut Nauk Leśnych Instytut Nauk Ogrodniczych Instytut Nauk o Zwierzętach Instytut Nauk o Żywności Instytut Nauk o Żywieniu Człowieka Instytut Nauk Socjologicznych i Pedagogiki Instytut Rolnictwa Instytut Zarządzania Na uczelni są również jednostki ogólnouczelniane takie jak:
Biblioteka Główna im. Władysława Grabskiego Muzeum SGGW Uniwersytet Otwarty Studium Praktycznej Nauki Języków Obcych Studium Wychowania Fizycznego i Sportu.