miejsce RL Nord FC Ingolstadt 04 Ingolstadt 2. miejsce RL Süd Rot-Weiss Oberhausen Oberhausen 2. miejsce RL Nord
Tabela Poz.KlubMPkt.MeczeBramkizwy.rem.por.zdob.stra.1SC Freiburg 34 68 21 5 8 60 3621. FSV Mainz 05 34 63 18 9 7 62 3731. FC Nürnberg 34 60 16 12 6 51 294Alemannia Aachen 34 56 16 8 10 58 385SpVgg Greuther Fürth 34 56 16 8 10 60 466MSV Duisburg 34 55 14 13 7 56 3671. FC Kaiserslautern 34 52 15 7 12 53 488FC St. Pauli 34 48 14 6 14 52 599Rot-Weiss Oberhausen 34 42 11 9 14 35 5410Rot-Weiss Ahlen 34 41 11 8 15 38 5711FC Augsburg 34 40 10 10 14 43 4612TSV 1860 Monachium 34 39 9 12 13 44 4613Hansa Rostock 34 38 8 14 12 52 5314TuS Koblenz 34 38 * 11 8 15 47 5715FSV Frankfurt 34 38 9 11 14 34 4716VfL Osnabrück 34 36 8 12 14 41 6017FC Ingolstadt 04 34 31 7 10 17 38 5418SV Wehen Wiesbaden 34 27 5 12 17 28 49Legenda:awans do Bundesligibaraże o awans do Bundesligi baraże o pozostanie w 2. Bundeslidzespadek do 3. Ligi źródło: SC Freiburg i 1. FSV Mainz 05 awansowały do Bundesligi 2009/10. 1. FC Nürnberg wygrał swoje mecze barażowe i awansował do Bundesligi 2009/10. VfL Osnabrück przegrał swoje mecze barażowe i spadł do 3. Ligi 2009/10. SV Wehen Wiesbaden i FC Ingolstadt 04 spadły do 3. Ligi 2009/10. * TuS Koblenz rozpoczął sezon z 3.