W badaniu ogólnym moczu rozpoznaje się białkomocz i hemoglobinurię.
Leczenie Bezobjawowych chorych nie leczy się, chyba że parazytemia utrzymuje się powyżej 3 miesięcy.
W łagodnej i umiarkowanej babeszjozie stosuje się atowakwon i azytromycynę przez 7–10 dni. Alternatywą jest leczenie klindamycyną i chininą. U osób z niedoborem odporności farmakoterapia powinna minimum najmniej 6 tygodni, w tym 2 tygodnie po uzyskaniu niewykrywalności pasożytów.
U chorych z chorobą ciężką stosuje się dożylnie klindamycynę i doustnie chininę. Alternatywnie może stosowane połączenie pentamidyny i trimetoprimu-sulfametoksazolu, połączenie atowakwonu z prokwanilem, połączenia doksycykliny, klindamycyny i azytromycyny. W bardzo ciężkiej parazytemii lub przy powikłaniach zagrażających życiu stosuje się transfuzję wymienną.
Rokowanie U chorych ze sprawnym układem odpornościowym choroba przebiega łagodnie, śmiertelność wynosi około 7%. U chorych po usunięciu śledziony choroba przebiega ciężko i śmiertelność sięga 50%.