W latach 1983–1988 Gassis był administratorem apostolskim Al-Ubajjid. 15 maja 1988 wyświęcony na biskupa został biskupem diecezji Al-Ubajjid. Jako jedyny mówiący po arabsku biskup sudańskiej konferencji episkopatu prowadził rozmowy z przedstawicielami rządu. Rząd Sudanu wniósł akt oskarżenia przeciwko biskupowi Gassisowi, gdy ten złożył oświadczenie przed Kongresem USA, w którym informował o zbrodniach popełnianych przez władze przeciwko własnemu narodowi. Za swoją działalność w obronie ludności chrześcijańskiej swojego kraju i nawoływanie do respektowania praw człowieka przez rząd w Chartumie bp Gassis był nagradzany wieloma nagrodami. Do śmierci rezydował w Kenii. Podróżował po Europie i Północnej Ameryce, prosząc o pomoc w wymuszeniu przestrzegania praw człowieka w Sudanie. Informował opinię publiczną o prześladowaniach religijnych na ludności chrześcijańskiej, bombardowaniu osiedli ludzkich, terroryzowaniu głodem i morderstwach.
W 2011 bp Gassis gościł w Polsce z okazji III Dnia Solidarności z Kościołem Prześladowanym.
28 października