Tefé było niegdyś pod względem powierzchni największą gminą w Brazylii i na świecie; w połowie XIX wieku liczyło około 500 000 km². Później z jego terytorium dokonano licznych wydzieleń, w wyniku których powstały nowe, samodzielne gminy. W związku z tym w 1911 roku utworzono gminę Xibauá, która dwa lata później, w 1913 roku, przyjęła nazwę Carauari. Carauari zostało jednak zniesione w 1930 roku, a następnie przywrócone w 1931 roku.
10 grudnia 1981 roku, w wyniku nowego podziału terytorialnego w stanie Amazonas, który doprowadził do utworzenia wielu gmin w tym stanie, osada Itamarati została podniesiona do rangi samodzielnej gminy stanu Amazonas na mocy poprawki konstytucyjnej nr 12 z tego roku. Terytorium Itamarati wydzielono z gminy Carauari oraz z części obszaru terytorialnego sąsiedniej gminy Tapauá.
Geografia Gmina Itamarati jest położona w stanie Amazonas, w mezoregionie Południowo-Zachodniego Amazonas (Mesorregião do Sudoeste Amazonense), który obejmuje 16 gmin stanu, zorganizowanych w ramach dwóch mikroregionów.