W 1984 objął kierownictwo projektu utworzenia Australian Defence Force Academy, wspólnej akademii dla wszystkich rodzajów australijskich sił zbrojnych. W latach 1984–1986 był pierwszy komendantem Akademii. W 1987 został dowódcą operacyjnym RAN. W 1989 zajmował krótko stanowisko zastępca szefa sztabu RAN, po czym w wieku 55 lat przeszedł na wojskową emeryturę.
Kariera cywilna Początkowo po odejściu z wojska planował osiąść na swojej farmie w okolicy miasteczka Tea Gardens i zająć się hodowlą bydła. W 1990 na prośbę władz Nowej Południowej Walii dowodził operacją ratowniczą w trakcie powodzi, jaka nawiedziła wówczas część stanu. W tym samym roku na raka płuca wywołanego przez służbę na pełnych azbestu okrętach zmarł jego kolega z RAN David Martin, który przez nieco ponad półtora roku pełnił urząd gubernatora Nowej Południowej Walii. Ówczesny premier stanu Nick Greiner uznał, że wypada, aby w tej sytuacji następcą Martina został inny oficer i zaproponował na to stanowisko Sinclaira. Po uzyskaniu akceptacji Elżbiety II, którą gubernator formalnie reprezentuje w swoim stanie, 8 sierpnia 1990 został zaprzysiężony.