Baza Podobnie jak w grze Dungeon Keeper, gracz ma za zadanie zbudować własną tajną bazę oraz zatrudnić sługi, którzy będą jej bronić przed siłami sprawiedliwości. Baza mieści się na odosobnionej wyspie. W trakcie gry gracz ma do swojej dyspozycji dwie wyspy: jedną pustynną oraz drugą tropikalną z wulkanem pośrodku. Obiekt składa się z wielu pomieszczeń o różnym przeznaczeniu, takich jak baraki dla mieszkańców, laboratoria czy pomieszczenia treningowe. W miarę postępów w grze gracz otrzymuje dostęp do nowych pomieszczeń.
Pułapki i urządzenia obronne służą do ochrony bazy przed agentami, zbierania dowodów, kradzieży pieniędzy i sabotażu. Niektóre z nich mogą zranić lub zabić intruzów, inne ogłuszają ich lub zmuszają do opuszczenia wyspy. Do pułapek należą: miotacze ognia, gazy bojowe oraz pułapka energetyczna wykorzystująca transformator Tesli. Za każdego agenta, który wpadnie w pułapkę gracz jest nagradzany pieniędzmi. Nagroda kumuluje się, jeżeli kilka pułapek jest połączonych w reakcję łańcuchową.