Struktura informacji przekazywanych SB przez Kellera na temat świata nauki nie różniła się od tej związanej z Kościołem katolickim. Najczęściej koncentrował się na osobach, których postępowanie oraz twórczość naukową krytycznie oceniał. Jego ostatnie zachowane doniesienie pochodzi z 1970 r. W 1988 został na kilka miesięcy pozyskany do współpracy jako konsultant o ps. „Profesor”. Miał za zadanie sporządzać opinie eksperckie na temat różnych zagadnień związanych z Kościołem katolickim i innymi wyznaniami funkcjonującymi w PRL. Do transformacji ustrojowej zdążył przygotować niewielką liczbę materiałów. W maju 1989 r. zakomunikował swojemu oficerowi prowadzącemu, że nie ma ochoty na dalszą współpracę.
Prace naukowe Jest autorem ponad 200 publikacji, w tym: Czyn jako wyraz postawy moralnej A. Cieszkowskiego (1948) Etyka (1954–1957, 2 tomy) Etyka katolicka (1957) Pojęcie, geneza i struktura religii (1967) Szkice o moralności katolickiej (1967) Zarys dziejów religii (1968, wyd. 2 1975, wyd. 6 1988) (red. wspólnie z Zygmuntem Poniatowskim) Studia o modernistach katolickich (1968) Katolicyzm jako religia i ideologia (1969) Od Mojżesza do Mahometa (1969) Zwyczaje, obrzędy i symbole religijne (1974) Kultura a religia (1977) Zarys religioznawstwa marksistowskiego (cz.