Ważniejsze ordery, odznaczenia i nagrody 1959 – nagroda Komitetu ds. Urbanistyki i Architektury 1959, 1979, 1982 – nagrody resortowe II stopnia 1956–1961 – siedem nagród i wyróżnień w konkursach SARP 1964 – Złoty Krzyż Zasługi 1964 – Krzyż Partyzancki 1976 – Krzyż Kawalerski Orderu Odrodzenia Polski 1994 – srebrny medal Ecclesiae Populoque Servitium Praestanti (Zasłużony w posłudze dla Kościoła i Narodu) 1995 – srebrny Krzyż Zasługi z Mieczami 1995 – Krzyż Walecznych 1996 – Krzyż Armii Krajowej 2008 – Krzyż Oficerski Orderu Odrodzenia Polski (za wybitne zasługi dla niepodległości Rzeczypospolitej Polskiej, za działalność na rzecz środowisk kombatanckich) 2015 – pamiątkowa szabla oficerska w uznaniu zasług dla Ojczyzny wręczona przez Szefa Urzędu do Spraw Kombatantów i Osób Represjonowanych

W uznaniu zasług dla środowiska kombatanckiego Janusz Stępkowski został w 2008 roku awansowany do stopnia podpułkownika. W dniu 9 maja 2013 roku został awansowany na pułkownika.