W wyniku Herezji Horusa, w której Imperium odniosło pyrrusowe zwycięstwo, jego ekspansja znacząco spowolniła i jest ono ze wszystkich stron otoczone przez zagrażających mu wrogów.
Pomimo że fabularnie Imperium jest jednym państwem, w systemie gry figurkowej zostało podzielone na wiele frakcji, co daje graczom najszerszy wybór modeli oraz stylów gry związanych z poszczególnymi armiami. W skład sił imperialnych wchodzą:
Adeptus Astartes (Kosmiczni Marines) Początkowo Kosmiczni Marines zostali stworzeni na potrzeby Wielkiej Krucjaty, która w 30 tysiącleciu miała odbić wszystkie światy na których kiedykolwiek mieszkali ludzie i wcielić je do rozrastającego się Imperium. Początkowo byli zrzeszeni w Legionach, na czele których stali Prymarchowie – genetycznie zmodyfikowani superludzie zaprojektowani przez samego Imperatora, którzy służyli też jako genetyczne wzorce dla swoich legionów. Po Herezji Horusa lojalne Legiony zostały podzielone na mniejsze zakony (ang. Chapter), z których każdy kontynuuje swoje własne tradycje -zazwyczaj pochodzące od tradycji jego pierwotnego Legionu. Większość zakonów nie wierzy w boskość Imperatora, lecz mimo to darzy go fanatycznym szacunkiem jako największego spośród ludzi.