Opis utworu „My Heart Is Broken” zostało napisane przez Amy Lee, Terry’ego Balsamo, Tima McCorda i Zacha Williamsa i zostało wyprodukowane przez Nicka Raskulinecza. Piosenka została nagrana w Blackbird Studio w Nashville w Tennessee. W wywiadzie, Amy Lee stwierdziła, że pierwotnie napisała piosenkę na harfę. Dodała, że zespół napisał utwór wraz z What You Want, a partia fortepianu na początku utworu została napisana na harfę, która była wolniejszym i łatwiejszym instrumentem dla niej. Jednakże podczas wstępnej produkcji Evanescence zmieniło tempo utworu na szybsze, więc kiedy nadszedł czas, aby nagrać utwór, nie można było zagrać go na harfie. Lee powiedziała, że piosenka brzmiała lepiej z partią fortepianu, bo to był silniejszy i bardziej widoczny instrument, który sprawił, że utwór stał się „jednym z najbardziej pasjonujących utworów w całym albumie”. W innym wywiadzie dla magazynu rockowego Kerrang! Lee ujawniła inspirację „My Heart Is Broken”, mówiąc: „Mój dobry przyjaciel prowadzi organizację w Nowym Jorku, która ratuje ofiary handlu seksem. Ja i mój mąż zaangażowaliśmy się i naprawdę byliśmy wzruszeni i przerażeni.