cmentarz rozbudowano, ale już w 1884 r., kiedy cmentarz otoczyła zabudowa mieszkalna, został zamknięty, a jego funkcje grzebalne przejął cmentarz Malvazinky.
Reorganizacji cmentarza Małostrańskiego dokonał Josef Bohumír Mikan (1743-1814), lekarz, botanik i profesor Uniwersytetu Karola w Pradze.
Cmentarz Małostrański zainspirował Jana Nerudę do napisania zbioru wierszy Cmentarne kwiaty (Hřbitovní kvítí, 1857).
Obecnie, aby uniknąć aktów wandalizmu, cmentarz jest zamknięty, a wejście nań jest możliwe jedynie po wcześniejszym uzgodnieniu. Cmentarzem opiekuje się stowarzyszenie Sdružení pro záchranu Malostranského hřbitova (Stowarzyszenie Ratowania Cmentarza Małostrańskiego), które ponadto organizuje imprezy kulturalne na terenie cmentarza.
Jednym z najcenniejszych zabytków cmentarza Małostrańskiego jest nagrobek biskupa pasawskiego Leopolda von Thun und Hohenstein (1748-1826), autorstwa Václava Prachnera.
Niektóre osoby pochowane na cmentarzu Kilián Ignác Dientzenhofer (zm. 1751) – najwybitniejszy architekt czeskiego baroku Kryštof Dientzenhofer (zm. 1722) – czeski architekt barokowy Jan Ladislav Dussek (zm. 1812) – czeski kompozytor i pianista František Xaver Dušek (zm. 1799) – czeski kompozytor, klawesynista i pianista Josef Vojtěch Hellich (zm. 1880) – czeski malarz i archeolog Ludvík Kohl (zm.