Po powrocie do Warszawy początkowo był kurierem AK, którego wysłano do Florencji. W połowie 1944 Czesław Kopczyński ps. Gandhi wprowadził Jerzego i jego siostrę do batalionu „Parasol”. Jerzy został żołnierzem, a jego siostra łączniczką. W lipcu tego roku otrzymał przydział do Kedywu KG AK, 3 plutonu 1 kompanii batalionu AK „Parasol”.
Powstanie warszawskie W powstaniu warszawskim był członkiem 3 plutonu 1 kompanii batalionu AK „Parasol” w Zgrupowaniu „Radosław” i walczył na Woli. Wraz z batalionem walczył m.in. o pałacyk Michla przy ulicy Wolskiej 40. Oprócz tego bronił cmentarzy kalwińskiego i ewangelickiego.
Od 9 sierpnia walczył na Starym Mieście. Otrzymał przydział w batalionie NOW-AK „Gustaw” w oddziale specjalnym „Juliusz”, gdzie był dowódcą sekcji łączników i butelkarzy. W tej dzielnicy uczestniczył w obronie Państwowej Wytwórni Papierów Wartościowych przy ulicy Sanguszki 1. Podczas tych walk, 24 sierpnia został ranny w głowę i stracił oko. Po przeprowadzonej operacji powrócił do swojego batalionu.